In App Purchase のアイテム数の上限が 3000 個に増えました。

これまでは 1000 個が上限でしたが 3 倍の 3000 個に拡張されました。
他にも今回のバージョンでは下記のように変更点がたくさんあるので、改めて新しいガイドには目を通しておくといいと思います。

Version 5.6 - June 14, 2010

Support for iAd including iAd Network contract request, enabling for iAds and visibility of the iAd Net- work module on iTunes Connect

iTunes Connect Mobile iPhone App released

In App Purchase limit raised to 3000

Ability to delete an app from your iTunes Connect view

Promotional Codes request process enhancements

High resolution screenshot (960x640, 960x600, 640x960, 640x920) and small icon (114x114) require- ments

Crash log fetching on demand

iTunes Connect Developer Guide